Sous l'impulsion de l'ANAPEZA, de Mgr Charles MBOGHA et de l'Abbé Etienne TANDELE, les premières pierres sont posées fin 1995. L'agrément provisoire en 1998 marque la reconnaissance officielle de cet engagement.
Après avoir formé ses premiers gradués en 2001, l'institution rejoint le patrimoine de l'État congolais en 2004, structurant ses premiers départements d'excellence : FLA, HSS, MP et B-C.
Pour répondre aux besoins des écoles secondaires locales, l'ISP innove avec l'ouverture des départements ACA, GCA et GAISF, renforçant son ancrage dans le milieu éducatif.
Le 20 octobre 2021 marque un tournant historique avec l'autorisation du second cycle. De nouvelles filières voient le jour : Sciences Agronomiques, Vétérinaires et Secrétariat Commercial.